Le collezioni del fondo museale sono esposte in modo permanente al primo e al secondo piano, mentre al piano terra, oltre alle strutture della vecchia chiesa conventuale, trovano spazio le mostre temporanee.
Al primo piano è posta la collezione del museo di scienze naturali. I reperti sono conservati nelle originali teche che furono utilizzate dalla Fondazione “G. G. Galletti”, così da proporre il fascino dell’allestimento di un museo naturalistico ottocentesco. Sono inoltre custoditi i reperti del museo, del Traforo del Sempione e di botanica.
All’ultimo piano sono esposte le collezioni di pittura (ritratti, pale d’altare, paesaggi) con una selezione di pittori vigezzini, arte sacra (scultura, oreficeria), numismatica e tessuti.
Le collezioni in esposizione sono la testimonianza di lunghi anni di acquisizioni da parte della Fondazione e di donazioni di appassionati e professionisti legati al territorio della Val d’Ossola.